Sekolah Menengah Tzu Chi mencakup kelas 7-12, menawarkan perjalanan akademis yang komprehensif:

1. Kelas 7-10 mengikuti International Baccalaureate Middle Years Program (IBMYP), yang membina pemikiran kritis dan mempersiapkan siswa untuk studi Program Diploma (DP).
2. Kelas 11-12 mengikuti International Baccalaureate Diploma Program (IBDP), yang terkenal dan sangat dihargai karena persiapan universitasnya secara global.
3. Terakreditasi sebagai Sekolah Dunia IB, Sekolah Menengah Tzu Chi menawarkan program MYP dan DP, bersamaan dengan pendaftaran Sekolah SPK (Satuan Pendidikan Kerjasama) di Indonesia.